Speciální limnologie

Stratifikace a míchání jezer, geografická variabilita hlavních abiotických faktorů určujících hydrodynamiku a produktivitu jezer; unikátní jezerní ekosystémy (stará jezera ancient lakes, Velká jezera Great Lakes, antarktická jezera); paleolimnologie; ekologická stechiometrie a homeostáze v limnologii; pelagické potravní sítě v různých typech vodních ekosystémů; specifika údolních nádrží; rybnikářství; specifika tekoucích vod, bentické a hyporheické biofilmy; Rámcová směrnice EU o vodě; acidifikace a biologické zotavování jezer.