Základy proteomiky

Základních znalostí z oboru proteomiky: 1. Úvod do proteomiky, vymezení pojmu, historie, aplikace proteomiky v řešení biologických problémů: výhody, omezení, top-down a bottom-up přístupy 2. Aplikace proteomiky v řešení biologických problémů: vývinová proteomika, proteomika stresem ovlivněných organizmů, proteomika mutantů, proteomika organel, klinická proteomika 3. Průběh proteomické analýzy, přehled proteomických metod 4. Příprava vzorku pro proteomické analýzy - zásady při práci s bílkovinami, homogenizace, solubilizace bílkovin, precipitace, frakcionace, detergenty 5. Dvourozměrná elektroforéza - princip, aplikace, izoelektrická fokusace na stripech s praktickou demonstrací, polyakrylamidová elektroforéza, metody detekce proteinů na gélech 6. Dvourozměrná elektroforéza - dokumentace, softverové vyhodnocení, profiling 7. Bezgelové proteomické analýzy - MuDPiT: principy, separace peptidů 8. Štěpení proteinů: teorie, zásady, metody 9. Úvod do hmotnostní spektrometrie: teorie, demonstrace hmotnostního spektrometru, 10. Úvod do interpretace a vyhodnocení proteomických dat 11. Posttranslační modifikace bílkovin: teorie, možnosti proteomické detekce 12. Fosforylace proteinů: princip, úlohy, fosfoproteomika